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天山沿线地区(中国)常见种子植物DNA条形码的遴选
天山沿线地区(中国)常见种子植物DNA条形码的遴选
作者:
刘彦廷
张明理
张道远
原文服务方:
东北林业大学学报
种子植物
DNA条形码
天山
摘要:
于2015年7—8月份,对中国天山沿线地区(北纬39°25′12″~45°5′3″、东经75°2′28″~94°27′51″)的荒漠带、山地草原带、山地森林带、亚高山草原带、亚高山草甸带、高山草甸带的优势种和建群种进行了补充采集,每个物种尽可能选择2个或2个以上的个体,共采集113种250份植物样品;应用最大似然树( ML Tree)的方法,对天山沿线地区(中国)的306种植物进行DNA条形码分析,从物种与属水平统计了4个候选DNA条形码( ITS、matK、rbcL、trnH-psbA)在整体与多种属两方面的识别率差异,遴选天山沿线地区常见种子植物的DNA条形码.结果表明:整体上,ITS在单条形码中的识别率最高,为81.70%(种)、97.07%(属);多条形码组合分析中,ITS+matK+trnH-psbA的识别率最高,为86.66%(种)、96.59% (属),其次为ITS+matK(86.27% (种)、96.59% (属))、ITS+rbcL (86.66%(种)、95.12%(属)).对多种属的分析显示,ITS的识别率在单条形码中依然最高(69.28%(种)、98.08% (属));多条形码组合分析中,ITS+matK+trnH-psbA、ITS+matK的识别率最高,均为75.16%(种)、96.15%(属).综合分析结果,依据通用性、识别性、经济性的原则,推荐ITS+matK为天山沿线地区常见种子植物的DNA条形码.
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篇名
天山沿线地区(中国)常见种子植物DNA条形码的遴选
来源期刊
东北林业大学学报
学科
关键词
种子植物
DNA条形码
天山
年,卷(期)
2020,(8)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
33-37,41
页数
6页
分类号
Q943.2
字数
语种
中文
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1
张明理
干旱区生物地理与生物资源中国科学院重点实验室(中国科学院新疆生态与地理研究所)
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张道远
干旱区生物地理与生物资源中国科学院重点实验室(中国科学院新疆生态与地理研究所)
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DNA条形码
天山
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研究来源
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期刊影响力
东北林业大学学报
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-5382
CN:
23-1268/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7235
总下载数(次)
0
总被引数(次)
68015
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