高原肺水肿大鼠肺组织差异表达microRNA的筛选、生物学功能分析及验证

• 作者: 丁辉 侯世科 刘三立 刘子泉 樊毫军 蔡未
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 微小RNA 肺水肿 高原肺水肿 生物信息学分析法
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 13-18
• 页数: 6页
• 分类号: R563|R332
• 字数: 6489字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2020.06.004

摘要

目的 筛选高原肺水肿大鼠肺组织差异表达microRNA(miRNA),并分析其生物学功能.方法 将大鼠随机分为对照组和低氧24、48、72 h组,每组6只.低氧组建立大鼠高原肺水肿模型.各组处死后提取大鼠肺组织.利用miRNA 4.0-Rat芯片筛选出低氧组与对照组大鼠肺组织差异表达miRNA,采用miRanda和TargetScan两个数据库对筛选出的差异表达miRNA进行靶基因预测,并对其进行基因本体功能分析和信号通路分析.实时荧光定量PCR检测四组高原肺水肿大鼠肺组织中筛选出来相对表达强度上调、下调最为明显基因.结果 以差异表达倍数(FC值)>2.0为准,高原肺水肿大鼠肺组织差异表达miRNA 14种,上调的5种,下调的9种,其中持续上调的有rno-miR-344g、rno-miR-541-5p,下调的有rno-miR-3556b、rno-miR-101a-5p、rno-miR-361-3p.14种差异miRNA之间存在多个相互关联的靶基因如Med22、Plekhh2、Parg、Rora、Lrch1、Slcla2等.在生物学过程方面,差异表达miRNA主要参与核酸的调控、蛋白泛素化、信号通路、血管生理功能以及生物进程等;在细胞成分方面,差异表达miRNA主要影响细胞内组成如核浆、胞质、细胞器、细胞膜和细胞功能如神经元投射等;在基因分子功能方面,差异表达miRNA主要涉及生物分子有关的结合如蛋白结合等.涉及的信号通路主要有PI3K-Akt信号通路、癌症通路、细胞外基质受体相互作用通路等.与对照组相比,在各低氧组rno-miR-541-5p相对表达量升高,rno-miR-101a-5p相对表达量下降(P均<0.05).结论 在高原肺水肿大鼠的肺组织中差异表达miRNA有14种,它们之间存在许多交互作用靶基因.这些差异表达miRNA参与多种生物学功能和信号通路调控,如血管新生、血管发育、细胞黏附连接、转录因子结合、PI3K-Akt信号通路等,可能参与高原肺水肿的发病机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁辉	天津大学灾难医学研究院	48	497	11.0	20.0
2	樊毫军	天津大学灾难医学研究院	3	0	0.0	0.0
3	侯世科	天津大学灾难医学研究院	5	5	1.0	2.0
4	蔡未		1	0	0.0	0.0
5	刘子泉	天津大学灾难医学研究院	2	5	1.0	2.0