女性类风湿关节炎DNA甲基化特征

• 作者: 吴玉寒 应颖 张可悦 彭勇 潘迎紫 褚赞波 陈勇 黄娴倩
• 来源期刊: 中华临床免疫和变态反应杂志
• 关键词: 类风湿关节炎 DNA甲基化 基因芯片 GO分析 Pathway分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 425-433
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969∕j.issn.1673-8705.2020.05.003

摘要

目的 应用基因芯片技术对类风湿关节炎(RA)DNA甲基化特征进行研究,探讨DNA甲基化在RA发病机制中的作用.方法 随机选取本院门诊确诊为RA的12例女性患者作为RA组,体检的12名健康女性作为对照组,采用Infinium公司的基因芯片对两组受试者进行全基因组CpG岛DNA甲基化检测,筛选差异甲基化位点,采用Gene Ontology(GO)分析和Pathway分析对筛选基因进行功能分类和通路分析.结果 RA组与对照组相比,共有24183个CpG位点甲基化水平发生改变(P<0.05),其中有13672个高甲基化位点,10511个低甲基化位点.RA组显著差异甲基化位点共191个,共对应着115个基因,其中高甲基化基因如IL-26、PCSK6、MICB、NCF4、GALNT9、PHF19、ADAMTS4、ACTN1等,低甲基化基因如CYP2E1、SMAD3、SLC1A1、CD44、AGPAT1、KCNQ1、AHRR等.GO生物学过程分析显示,差异甲基化基因参与生物学过程富集于:细胞因子介导的信号通路、炎症反应、核转录因子-κB(NF-κB)信号通路、免疫反应调节、T细胞活化、透明质酸的代谢等;Pathway分析显示,RA组特异的差异甲基化基因与沙门菌感染、Toll样受体信号通路、炎性肠病、NF-κB信号通路、TRP通道的炎性介质调节、趋化因子信号通路、TNF信号通路、破骨细胞分化、系统性红斑狼疮等信号通路有关.结论 DNA异常甲基化可能参与了RA的发生发展,异常甲基化的基因可能成为RA评估发病、疾病进展和疾病严重程度的生物标记物或预测因子,也有望成为RA治疗的潜在靶点.