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摘要:
为了从分子水平上研究大豆幼苗对低钾胁迫的耐性机理,本研究首先依据生物量指标从25份大豆材料中筛选出耐低钾品种Lee 68,并对低钾胁迫下大豆Lee 68幼苗进行转录组测序和分析.通过对转录组Solexa/Illumina高通量测序数据的分析,共得到160 211 759个reads,将获得的数据与大豆Williams 82基因组序列比对,比对率达到92.83%以上.比较组LK_VS_CK中差异表达基因为3 521个,其中下调和上调基因分别为2 393和1 128个.GO功能聚类分析显示LK_VS_CK比较组的差异表达基因主要富集于植物的代谢过程、胁迫响应及信号转导;KEGG pathway 分析中,LK_VS_CK比较组有390个差异表达基因显著富集在19个pathway途径中,其中富集最为显著的是代谢途径,包括氨基酸代谢、脂肪酸和类脂代谢以及碳水化合物代谢等;COG分类统计结果表明LK_VS_CK比较组除649个差异表达基因具有一般性功能之外,377个基因被划分到转录因子功能类,343个基因被划分到信号转导机制功能中.结合差异表达基因的功能分析及茉莉酸信号转导调控机制,筛选到了茉莉酸信号途径上可能参与钾离子吸收转运过程的8个关键候选基因,分别是Glyma09g08290、Glyma09g33730、Glyma03g32890、Glyma04g39010、Glyma08g09720、Glyma12g36310、Glyma16g32821、Glyma19g45260.研究结果对深入研究大豆钾胁迫下与钾离子高效吸收相关基因的调控及克隆研究具有重要的参考价值.
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文献信息
篇名 耐低钾大豆品种筛选及低钾胁迫下Lee 68的差异表达基因分析
来源期刊 大豆科学 学科
关键词 大豆 低钾胁迫 差异表达基因 转录组测序
年,卷(期) 2020,(4) 所属期刊栏目 遗传育种·分子生物学
研究方向 页码范围 489-499
页数 11页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.11861/j.issn.1000-9841.2020.04.0489
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陈新 南京农业大学生命科学学院 7 22 2.0 4.0
5 陈华涛 江苏省农业科学院经济作物研究所 89 391 9.0 14.0
6 陆潭 南京农业大学生命科学学院 2 0 0.0 0.0
10 张威 江苏省农业科学院经济作物研究所 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
大豆
低钾胁迫
差异表达基因
转录组测序
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
大豆科学
双月刊
1000-9841
23-1227/S
大16开
哈尔滨市南岗区学府路368号
14-95
1982
chi
出版文献量(篇)
3361
总下载数(次)
6
总被引数(次)
32053
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导