耐低钾大豆品种筛选及低钾胁迫下Lee 68的差异表达基因分析

• 作者: 张威 陆潭 陈华涛 陈新
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆 低钾胁迫 差异表达基因 转录组测序
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 489-499
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2020.04.0489

摘要

为了从分子水平上研究大豆幼苗对低钾胁迫的耐性机理,本研究首先依据生物量指标从25份大豆材料中筛选出耐低钾品种Lee 68,并对低钾胁迫下大豆Lee 68幼苗进行转录组测序和分析.通过对转录组Solexa/Illumina高通量测序数据的分析,共得到160 211 759个reads,将获得的数据与大豆Williams 82基因组序列比对,比对率达到92.83％以上.比较组LK_VS_CK中差异表达基因为3 521个,其中下调和上调基因分别为2 393和1 128个.GO功能聚类分析显示LK_VS_CK比较组的差异表达基因主要富集于植物的代谢过程、胁迫响应及信号转导;KEGG pathway 分析中,LK_VS_CK比较组有390个差异表达基因显著富集在19个pathway途径中,其中富集最为显著的是代谢途径,包括氨基酸代谢、脂肪酸和类脂代谢以及碳水化合物代谢等;COG分类统计结果表明LK_VS_CK比较组除649个差异表达基因具有一般性功能之外,377个基因被划分到转录因子功能类,343个基因被划分到信号转导机制功能中.结合差异表达基因的功能分析及茉莉酸信号转导调控机制,筛选到了茉莉酸信号途径上可能参与钾离子吸收转运过程的8个关键候选基因,分别是Glyma09g08290、Glyma09g33730、Glyma03g32890、Glyma04g39010、Glyma08g09720、Glyma12g36310、Glyma16g32821、Glyma19g45260.研究结果对深入研究大豆钾胁迫下与钾离子高效吸收相关基因的调控及克隆研究具有重要的参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈新	南京农业大学生命科学学院	7	22	2.0	4.0
5	陈华涛	江苏省农业科学院经济作物研究所	89	391	9.0	14.0
6	陆潭	南京农业大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
10	张威	江苏省农业科学院经济作物研究所	1	0	0.0	0.0