白花泡桐丛枝病发生过程中全基因组 DNA甲基化差异分析

• 作者: 张靖曼 杨海波 范国强 赵振利 郑秋莉
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 白花泡桐 泡桐丛枝病 全基因组甲基化测序 DNA甲基化
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 林业科学
• 页码范围: 400-407
• 页数: 8页
• 分类号: S792.43
• 字数: 5433字
• 语种: 中文

摘要

为探究泡桐丛枝病(Paulownia witches'broom,PaWB)的表观遗传机制,以白花泡桐健康苗(PF)和丛枝病苗(PFI)为材料,采用全基因组甲基化测序(WGBS)技术对白花泡桐丛枝病发生过程中全基因组DNA甲基化进行系统研究.结果表明,白花泡桐体内的DNA甲基化主要有mCG、mCHH和mCHG 3种类型;白花泡桐被植原体侵染后,C位点发生甲基化的比率下降,且发病后CHH的甲基化比率降低而CG和CHG的甲基化比率升高.此外,DNA甲基化主要发生在CG序列;差异甲基化区域(DMR)鉴定研究中共检测到了109334个DMR,其中白花泡桐患病后高甲基化DMR和低甲基化DMR分别有37408个和71926个;通过DNA甲基化和转录组的差异表达基因关联分析,找到了6个与PaWB发生相关的差异甲基化基因(DMG),功能分别涉及到植物防御反应、光合作用、植物病原互作、植物激素信号转导等生物学过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	范国强	河南农业大学泡桐研究所	106	1402	22.0	31.0
2	赵振利	河南农业大学泡桐研究所	59	389	11.0	17.0
3	张靖曼	河南农业大学泡桐研究所	1	0	0.0	0.0
4	郑秋莉	河南农业大学泡桐研究所	1	0	0.0	0.0
5	杨海波	河南农业大学泡桐研究所	1	0	0.0	0.0