原发性干燥综合征差异基因及潜在治疗药物的生物信息分析

• 作者: 徐华 陈佳
• 来源期刊: 临床荟萃
• 学科: 医学
• 关键词: 干燥综合征 生物信息 差异基因
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 533-540
• 页数: 8页
• 分类号: R593.22
• 字数: 3896字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-583X.2020.06.011

摘要

目的 利用基因表达谱筛选与原发性干燥综合征(pSS)相关基因和潜在小分子治疗药物.方法 在GEO数据库获取并分析3个pSS相关基因表达谱,获得差异表达基因,并对差异基因进行GO与KEGG富集分析,通过蛋白互作网络(PPI)筛选pSS的hub基因并验证.最后,利用Cmap数据库预测pSS的潜在治疗药物,并结合药物靶点和药物途径探讨潜在药物在pSS治疗中的作用.结果 共鉴定出90个pSS相关差异基因,其中79个上调基因,11个下调基因,它们主要参与NOD样受体信号通路、甲型流感和细胞因子-细胞因子受体相互作用通路.此外,通过筛选、验证,鉴定出19个hub基因(STAT1、MX1、ISG15、IFIH1、GBP1、IFIT1、XAF1、RSAD2、IFIT2、SAMD9L、TRIM22、IFIT3、IFI44L、HERC5、IFIT5、IFI44、IFI6、RTP4和ISG20),多个是干扰素诱导基因.干扰素可能在pSS发病中起重要作用.最后,通过CMAP数据库筛选出氟替卡松、氯唑西林等15种候选药物,并对其作用通路与靶点分析.结论 本研究通过对pSS hub基因和候选药物的筛选,可以进一步了解pSS的发病机制,为pSS的进一步研究提供线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈佳	盘锦辽油宝石花医院全科医学科	2	0	0.0	0.0
2	徐华	盘锦辽油宝石花医院检验科	2	0	0.0	0.0