SELL基因与蛋白质的生物信息学分析

• 作者: 李娜 杨健康
• 来源期刊: 生物技术
• 关键词: SELL 基因 蛋白质 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 技术与方法|Technique and Method
• 页码范围: 549-554,583
• 页数: 7页
• 分类号: R394.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2020.06.0086

摘要

[目的]分析SELL基因的基因表达情况、CpG岛、启动子、转录因子结合位点;分析SELL蛋白的亚细胞定位、同源性、理化性质、信号肽和跨膜区域、蛋白质二三级结构及相互作用蛋白.[方法]利用Promoter2.0、MethPrime、AliB-aba2.1、ProtParam、ProtScale、Clustal Omega、PSORTII、SignalP4.1、TMHMM、SWISS-MODEL、STRING 等生物信息学软件对SELL进行系统分析.[结果]SELL基因至少含有1个启动子,启动子区不存在CpG岛.SELL基因在人体多种正常组织中均有表达,在全血中表达最高.SELL蛋白是有信号肽由372个氨基酸组成的、有跨膜区域的亲水蛋白.主要定位于细胞质和细胞核,二级结构以随机卷曲为主.分析结果显示SELPLG、MADCAM1、CD34、CD44、PTPRC、CD69、CCR7、ITGAM、FOXP3、IL7R蛋白可能与SELL蛋白存在相互作用.[结论]对人SELL基因和编码蛋白进行生物信息学分析,获得了基因的特征及蛋白发挥的功能.