玉树牦牛与四个牦牛群体线粒体DNA D-Loop区遗传多样性分析

• 作者: 侯孟典 信金伟 宋仁德 尕才仁 杨玉文 柴志欣 汪永洲 王会 钟金城
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉树牦牛 分子标记 线粒体DNA D-Loop区 遗传距离 系统发育树
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 21-26
• 页数: 6页
• 分类号: S811.5
• 字数: 4708字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1182.2020.03.004

摘要

利用线粒体DNA标记方法从分子水平上研究牦牛的遗传多样性.根据牦牛线粒体DNA(mtDNA)序列设计引物,扩增出长度为1 000 bp左右的片段,序列对比分析.结果 表明:mtDNA D-Loop区长度为945 bp,共发现变异位点127个,单倍型71个,单倍型多样度(Hd)为0.909±0.016,核苷酸多样性(pi)为0.082;其中玉树牦牛发现变异位点74个,单倍型27个,单倍型多样度(Hd)为0.885±0.034,核苷酸多样性(pi)为0.0134;申扎牦牛单倍型多样度、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数均最高;5个牦牛群体D-Loop区序列具有一定的A/T碱基偏好性.玉树牦牛不遵循中性进化(P＜0.05),其余4个牦牛群体符合中性进化(P＞0.05);玉树牦牛与类乌齐牦牛和帕里牦牛的遗传距离较近(0.023、0.018),申扎牦牛与斯布牦牛的遗传距离最远(0.533).发现玉树牦牛与其余4个群体的牦牛在同一个分支.斯布牦牛和申扎牦牛群体出现两个分支,说明玉树牦牛在进化的过程中可能不存在相互交流的情况.