iBAQ非标定量分析生物被膜形成能力不同的鲍曼不动杆菌的蛋白质组学差异

• 作者: 孙媛 张明 张正良 杨妮 王海 邬媛 雷莉
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: iBAQ非标记定量蛋白质组学 生物被膜 多重耐药 鲍曼不动杆菌
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 33-38,83
• 页数: 7页
• 分类号: R378.99
• 语种: 中文
• DOI: 10.7652/jdyxb202001007

摘要

目的 利用iBAQ(intensity-based absolute-protein-quantification)非标记定量蛋白质组学分析鉴定生物被膜形成能力不同的鲍曼不动杆菌株蛋白质组学差异.方法 64株临床分离的鲍曼不动杆菌株按生物被膜形成能力不同分为强组和弱组,收集两组菌株蛋白质样本进行FASP(filter-aided sample preparation)酶解,酶解产物进行LC-MS/MS质谱分析.使用Maxquant软件对LC-MS/MS原始文件进行查库以及iBAQ非标定量分析.Maxquant软件查库文件使用Perseus软件分析,通过GO(Gene Ontology)数据库对鉴定出的差异蛋白及特异蛋白从生物学过程、细胞成分和分子功能3方面进行功能注释,通过KAAS(KEGG automatic annotation server)分析差异蛋白涉及的代谢通路.结果 实验通过LC-MS/MS分析共鉴定到1120个肽段,457个蛋白质,其中13个蛋白质的表达在生物被膜形成能力强组和弱组间差异具有统计学意义,其中7个蛋白质在弱组显著性低表达,6个在强组显著性低表达.另外,还鉴定出在生物被膜形成能力弱组(7个)和强组(5个)特异性表达的蛋白质,并对其参与的细胞过程及信号通路进行了分析.结论 基于iBAQ的非标记定量蛋白质组学分析方法鉴定出多种与生物被膜形成能力相关的蛋白质,可为分析生物被膜形成的原因、机制及治疗提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张明	西安交通大学第二附属医院急诊科	215	982	14.0	21.0
2	张正良	西安交通大学第二附属医院急诊科	19	91	5.0	9.0
3	王海	西安交通大学第二附属医院急诊科	30	146	6.0	11.0
4	雷莉	西安交通大学第二附属医院急诊科	20	222	9.0	14.0
5	杨妮	西安交通大学第二附属医院急诊科	17	45	4.0	6.0
6	邬媛	西安交通大学第二附属医院急诊科	9	11	2.0	3.0
7	孙媛	西安交通大学第二附属医院急诊科	6	8	2.0	2.0