枸杞Lb_PPR1的克隆及其在不同育性品种中的表达分析

• 作者: 杨亚珺 石晶 管翠萍
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 枸杞 Lb_PPR1 生物信息 表达模式
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1521-1529
• 页数: 9页
• 分类号: S567
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0935

摘要

三角状五肽重复(Pentatricopeptide repeats,PPR)蛋白定位于多种细胞器中,参与细胞核和细胞器中特异单链RNA的转录后修饰和编辑,在植物生长发育的多个阶段均发挥着重要的作用.分别从枸杞(Lycium barbarum)雄性可育系'宁杞1号'和不育系'宁杞5号'中克隆了Lb_PPR1基因,并对其编码蛋白质进行理化性质、亚细胞定位、保守结构域、蛋白结构以及系统进化等方面进行预测分析.结果 显示,'宁杞1号'和'宁杞5号'中Lb_PPR1基因的开放阅读框均为1 977 bp,编码658个氨基酸,但其中存在20个碱基和14个氨基酸的差异.Lb_PPR1蛋白包含14个串联重复的PPR保守基序,属于PLS家族,该蛋白定位在细胞膜和细胞质.二级、三级结构预测显示该蛋白以α螺旋为主.同源进化分析得出Lb_PPR1蛋白与同属茄科的辣椒和烟草PPR蛋白亲缘关系最近.利用实时荧光定量PCR检测Lb_PPR1在枸杞不同组织器官及不同发育阶段花药中的表达特性.结果 显示,Lb_PPR1在枸杞不同组织中均有表达,但在可育系花蕾中表达量最高,不育系'宁杞5号'各组织中表达量均显著低于可育系'宁杞1号'.以上结果表明,Lb_PPR1基因可能与枸杞花药发育有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石晶	宁夏大学生命科学学院西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	26	33	4.0	5.0
2	管翠萍	宁夏大学生命科学学院西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	16	37	3.0	5.0
3	杨亚珺	宁夏大学生命科学学院西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	5	12	2.0	3.0