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海南省2019-2020年H3N2亚型流感病毒血凝素基因特性
海南省2019-2020年H3N2亚型流感病毒血凝素基因特性
作者:
孙初阳
崔蕾
李丹丹
潘家兴
王如敏
马焱
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
流感病毒
H3N2亚型
HA基因
遗传进化
摘要:
目的 了解海南省2019--2020年H3N2亚型流感病毒血凝素基因遗传进化规律与氨基酸变异情况.方法 选取2019-2020监测年度海南省5家流感监测网络实验室分离的16株H3N2亚型流感毒株进行一代全基因组测序,利用MEGA 10.1.8构建血凝素基因系统进化树,并分析氨基酸位点替换情况,应用DNA Star 7.0.1软件进行血凝素基因同源性分析.结果 系统进化树显示,相比于疫苗株A/Kansas/14/2017 (2019-2020),16株H3N2亚型流感病毒分离株血凝素基因在进化树上与疫苗株A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016(2018-2019)亲缘关系更近,属于3C.2a1分支,核苷酸与氨基酸同源性范围分别为98.5%~98.9%、97.9%~98.4%.16株分离株在抗原性位点发生8处氨基酸位点替换,涉及5个抗原决定簇;15株分离株在糖基化位点发生2处缺失.结论 2019--2020年监测年度海南省H3N2亚型流感病毒与2018-2019年疫苗株亲缘关系较近,血凝素蛋白抗原性位点在5个决定簇均有变异,易造成较大流行,WHO推荐的2019-2020年疫苗株保护效果可能不理想.应密切关注H3N2亚型流感病毒的流行与基因变异情况,为流感病毒疫苗株推荐及防控提供科学依据.
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文献信息
篇名
海南省2019-2020年H3N2亚型流感病毒血凝素基因特性
来源期刊
中国热带医学
学科
医学
关键词
流感病毒
H3N2亚型
HA基因
遗传进化
年,卷(期)
2020,(9)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
809-813
页数
5页
分类号
R373.1
字数
语种
中文
DOI
10.13604/j.cnki.46-1064/r.2020.09.03
五维指标
作者信息
序号
姓名
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马焱
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李丹丹
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H3N2亚型
HA基因
遗传进化
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中国热带医学
主办单位:
中华预防医学会
海南疾病预防控制中心
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-9727
CN:
46-1064/R
开本:
大16开
出版地:
中国海南省海口市海府路44号
邮发代号:
84-20
创刊时间:
2001
语种:
chi
出版文献量(篇)
13183
总下载数(次)
5
总被引数(次)
47402
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