普通烟草ALMT基因家族的鉴定与表达分析

• 作者: 刘萍萍 周会娜 张慧 徐国云 李泽锋 王晨 翟妞 郑庆霞 金立锋 金静静 陈千思
• 来源期刊: 烟草科技
• 学科: 工学
• 关键词: 烟草 ALMT基因家族 氯盐胁迫 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 烟草农学
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: TS414
• 字数: 3916字
• 语种: 中文

摘要

为了挖掘可能参与烟草氯离子吸收转运的铝激活苹果酸转运蛋白(Al-activated malate transporter,ALMT)基因家族成员,利用生物信息学方法,系统地分析了烟草ALMT基因家族成员的蛋白理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构和保守结构域等;利用qPCR的方法分析了烟草ALMT基因在不同组织中的表达情况,以及在盐(NaCl)处理下的表达特征.结果表明:普通栽培烟草基因组中鉴定出30个可能的ALMT家族基因,根据系统发育树可将其划分为五个亚组;NtALMT基因的基因结构和motif分布与其他物种一致,具有高度保守的WEP motif;组织表达特异性分析结果发现大多数NtALMT基因在茎中表达较高,只有NtALMT28在叶中表达量最高;氯盐处理下,茎中NtALMT10表达量升高8倍以上,叶中NtALMT19表达量升高25倍以上,暗示了这些基因可能与烟草氯离子吸收转运相关.