猪NR1H3基因可变剪接体的克隆及表达特性研究

• 作者: 吴怡琦 张雪莲 晋大鹏 曹果清 李文霞 李步高 秦本源 蔡春波 郭晓红 高鹏飞
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 NR1 H3基因 可变剪接 生物信息学 表达特征
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 43-54
• 页数: 12页
• 分类号: S828.2
• 字数: 7312字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.01.006

摘要

旨在克隆猪NR1H3基因的可变剪接体,并预测编码蛋白的结构与功能,研究其转录本的表达特性.本试验以马身猪为研究对象,采用RT-PCR及克隆测序技术对猪NR1H3基因CDS区进行扩增和克隆,采用生物信息学方法分析NR1 H3蛋白的生物学特性,采用qRT-PCR技术检测NR1H3基因在心、肝、脾、肺、肾、胃、小肠、股二头肌、腰大肌和皮下脂肪组织中的表达谱及在脂肪组织中的发育性表达规律.结果 表明,本研究成功克隆出猪NR1H3基因的两个转录本NR1H3-1和NR1H3-2,其中NR1H3-2为新发现的转录本(MN082630),其CDS区全长1 203 bp,编码的蛋白质含400个氨基酸,属于中性不稳定蛋白;与NR1H3-1相比,NR1H3-2缺失了长度为95 bp的第9外显子,编码的蛋白质NR1 H3-2比NR1H3-1少了一个肝X受体的配体结合结构域;氨基酸的相似性分析发现,猪NR1 H3蛋白氨基酸序列与北大西洋小须鲸、山羊、绵羊、抹香鲸、长江江豚等物种的相似性较高.NR1H3-1和NR1H3-2在所检测组织中均有表达,且在不同组织间的表达量具有显著差异(P＜0.05);NR1H3-1转录本在小肠中表达量最高,其次是脾、肝、股二头肌等,在心脏中表达量最低;NR1H3-2则在肝中表达量最高,其次是脾、小肠、胃和股二头肌等,在心脏中表达量最低.在各组织中(除小肠、心、肺),NR1H3-2的表达量均高于NR1H3-1,其中在肝和皮下脂肪组织中,NR1H3-2的表达量极显著高于NR1H3-1(P＜0.01),在胃中差异达显著水平(P＜0.05).随着日龄的增加,皮下脂肪组织中NR1H3-1和NR1H3-2的表达量整体呈上升趋势,推测该基因对猪的脂肪沉积有调控作用.本试验成功克隆了猪NR1 H3基因的两个可变剪接体,并推测其对猪脂质代谢及脂肪生成具有重要的生理作用.