湖南益阳黑茶中桔青霉线粒体全基因组序列测定及分析

• 作者: 刘石泉 刘素纯 徐正刚 文欣 胡治远
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黑茶 桔青霉 线粒体基因组 系统发育
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 830-844
• 页数: 15页
• 分类号: S571.1|Q939.5
• 语种: 中文

摘要

对黑茶中分离的一株桔青霉线粒体基因序列进行测定与分析,并探究其与近缘种微生物的系统发育关系.结果表明,桔青霉线粒体基因组是一条全长27537 bp的环状DNA分子,共编码42个基因(15个蛋白质编码基因,2个rRNA,24个tRNA以及1个独立的ORF),基因组碱基构成为:A(36.17％)、T(37.06％)、C(11.82％)、G(14.95％).15个蛋白质编码基因均采用典型的ATG作为起始密码子、TAA或TAG作为终止密码子,基因排列顺序与已报道的青霉属物种相似,在进化上较为保守.蛋白质编码基因编码频率较高的氨基酸分别为Leu、Ile、Ser和Phe;RSCU频率最高的4个密码子依次是UUA、AUA、UUU和GGU.24个tRNA基因存在30处G-U错配,均可形成典型三叶草结构.系统发育分析结果表明,桔青霉分类地位上关系最密切是Penicillium ShG4C,其次是Penicillium polonicum与Penicillium nordicum.