绿萝叶腐病病原菌16S rDNA序列的克隆与分析

• 作者: 张慧娟 徐凡舒 朱欣 蒋明 邬张颖 钟依妮 马佳莹
• 来源期刊: 贵州农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 绿萝 叶腐病病原菌 菌株LR12 胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种 16S rDNA 克隆
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 园艺·中药材
• 页码范围: 99-103
• 页数: 5页
• 分类号: S154.3|S636.2
• 字数: 3614字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3601.2020.01.022

摘要

为绿萝叶腐病病原菌菌株LR12的分子鉴定和应用研究提供参考,利用PCR法克隆其16S序列,并借助生物信息学方法进行分析,明确其16S rDNA序列特征.结果 表明:以YFUP/YFDN为PCR引物,扩增到大小约为1 700 bp的条带;LR12的16S rDNA全长为1 551 bp,GC为53.9％;LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种的16S rDNA相似性最高,达100％,与巴西亚种的相似性次之,为99.9％,两者存在2个碱基的差异;15种细菌在发育树上可分为5组,其中LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌巴西亚种的关系最近,处于同一分支,支持率达100％,并与其他2种果胶杆菌属细菌聚在同一组.