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AvrLr19突变菌株诱导TcLr19小麦中差异表达基因分析
AvrLr19突变菌株诱导TcLr19小麦中差异表达基因分析
作者:
刘大群
崔钟池
武文月
王婉晴
王海燕
胡铁猛
原文服务方:
河北农业大学学报
小麦
叶锈菌
Lr19
RNA-seq
差异表达基因
摘要:
为了探索小麦抗叶锈病基因Lr19抗叶锈病的分子机理,并筛选参与其抗病性防御反应的相关基因,本研究对接种小麦叶锈菌生理小种PHNT及其EMS突变体后的小麦材料'TcLr19'进行转录组测序及分析.与亲和互作反应相对比,在非亲和互作反应中筛选到2114个差异表达基因,其中上调差异表达基因1189个,下调差异表达基因925个.对1189个上调差异表达基因进行GO功能分析,部分差异表达基因被注释为在真菌的防御反应中发挥抗病功能;KEGG分析表明,一些与抗病相关的差异表达基因被富集到了过氧化物酶、氨基糖/核苷酸糖代谢和角质生物合成信号通路.同时,发现一些与Lr19同在7D染色体上的基因受叶锈菌诱导表达,并在非亲和互作反应中特异性表达.总之,本研究初步明确了参与Lr19抗叶锈病防御反应过程中抗病相关基因的种类以及抗病代谢通路,为探索Lr19的抗叶锈病机制提供了理论基础.
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文献信息
篇名
AvrLr19突变菌株诱导TcLr19小麦中差异表达基因分析
来源期刊
河北农业大学学报
学科
关键词
小麦
叶锈菌
Lr19
RNA-seq
差异表达基因
年,卷(期)
2020,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1-7
页数
7页
分类号
S432.1
字数
语种
中文
DOI
10.13320/j.cnki.jauh.2020.0086
五维指标
传播情况
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RNA-seq
差异表达基因
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
河北农业大学学报
主办单位:
河北农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-1573
CN:
13-1076/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1959-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
3463
总下载数(次)
0
总被引数(次)
35752
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