基于生物信息学探讨胰腺导管癌患者基因表达谱的变化

• 作者: 刘启玲 孙娜 张荣强 李向文 段丽芳 郭亚收
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: 胰腺癌 差异表达基因 转录谱 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 192-196
• 页数: 5页
• 分类号: R735.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.7652/jdyxb202002007

摘要

目的 分析胰腺癌患者癌组织和癌旁组织的差异表达基因特征及其关键调控蛋白,为胰腺癌的预防及治疗提供理论依据.方法 从Pubmed基因芯片数据库(GEO Database)中下载胰腺癌患者基因芯片数据,并将数据导入GCBI、networkAnalyst及Genclip等分析软件,分析癌组织和癌旁组织的基因表达谱、基因功能、蛋白质相互作用网络等,筛选两组之间的关键节点基因.结果 癌组织和癌旁组织的基因表达谱有明显差异;在分析的28869个基因中,癌组织和癌旁组织之间有4447(15.40％)个差异表达基因;前250个差异表达基因蛋白相互作用网络分析发现5个关键蛋白(SMURF1、MET、BCL2L1、RALA和ERBB4),主要与蛋白结合及细胞外区域信号通路密切相关.结论癌组织和癌旁组织的基因表达谱有明显不同,提示基因转录谱在肿瘤的发生中发挥着调节作用;SMURF1及MET基因对胰腺癌的发生均有一定的预测能力,并可能受到蛋白结合和细胞外区域信号通路的调节而发挥生物学作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张荣强	陕西中医药大学公共卫生学院	68	140	6.0	8.0
2	段丽芳	陕西中医药大学基础医学院	33	59	4.0	5.0
3	孙娜	陕西中医药大学公共卫生学院	52	70	5.0	6.0
4	郭亚收	咸阳市中心医院泌尿外科	6	2	1.0	1.0
5	李向文	陕西中医药大学公共卫生学院	13	13	2.0	3.0
6	刘启玲	公共卫生学院陕西中医药大学公共卫生学院	1	0	0.0	0.0