凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的遗传多样性分析

• 作者: 刘青云 彭敏 曾地刚 李强勇 杨春玲 林勇 赵永贞 陈慧芳 陈晓汉 陈秀荔
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 凡纳滨对虾 选育群体 微卫星(SSR)分子标记 遗传多样性 遗传变异
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 1442-1450
• 页数: 9页
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.06.026

摘要

[目的]明确凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的遗传变异情况及近亲繁殖对个体生长速度和抗病性的影响,为凡纳滨对虾种质改良提供理论依据.[方法]从GenBank收录的微卫星(SSR)引物序列中筛选11对能有效扩增的SSR引物,对2016—2018年桂海1号凡纳滨对虾连续3个世代选育群体(合计853个样品)进行遗传多样性分析,监测相邻2个世代选育群体间的遗传变异情况.[结果]11对SSR引物在凡纳滨对虾连续3个世代选育群体中共检测到103个等位基因,各SSR位点的等位基因数(Na)平均为9.3636个,有效等位基因数(Ne)平均为3.8355个,观测杂合度(Ho)平均为0.4794,期望杂合度(He)平均为0.7074,多态信息含量(PIC)平均为0.6708;除TUMXLv10.33位点呈中度多态性(0.25<PIC<0.50)外,其余10个SSR位点均为高度多态性.凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的平均PIC分别为0.6689、0.6657和0.6650,即均属于高度多态性(PIC>0.50);对应的平均Na为8.7272、7.3636和8.0000个,平均Ne为3.8676、3.7654和3.8010个,平均Ho为0.3975、0.5224和0.4876,平均He为0.7057、0.7057和0.7029.Hardy-Weinberg平衡检测结果显示,绝大部分SSR位点偏离Hardy-Weinberg平衡.凡纳滨对虾连续3个世代选育群体在11个SSR位点上的遗传分化系数(Fst)均小于0.0500,即凡纳滨对虾群体的遗传分化很小;凡纳滨对虾群体内近交系数(Fis)介于-0.0101～0.8098,平均为0.3543,且除C11654位点为负值外,其余SSR位点均为正值,表明凡纳滨对虾连续3个世代选育群体的近交程度较高.分子方差分析(AMOVA)结果显示,69.78％的遗传变异来源于凡纳滨对虾个体内,而29.96％的变异来源于凡纳滨对虾个体间.[结论]桂海1号凡纳滨对虾各世代选育群体尚具有较丰富的遗传变异,但群体遗传结构处于不稳定状态.因此,今后应通过人工选育方式保留有利突变、淘汰有害突变,同时避免近亲繁殖,或引进优质品种进行杂交以扩充基因库,保护凡纳滨对虾的遗传多样性,防止种质退化.