棉花基因组中赤霉素氧化酶基因的鉴定与分析

• 作者: 狄佳春 赵亮 陈旭升
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 赤霉素 赤霉素氧化酶 基因家族
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生理生化
• 页码范围: 553-560
• 页数: 8页
• 分类号: S562.01
• 字数: 3504字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2020.03.004

摘要

根据赤霉素氧化酶氨基酸序列的保守结构域和生物学信息,对棉花2个二倍体野生种(A基因组的亚洲棉和D基因组的雷蒙德氏棉)和2个异源四倍体遗传标准系(陆地棉TM-1和海岛棉H7124)进行了全基因组的查找.结果表明,在2个二倍体野生种的A和D基因组中分别预测到219和188个该酶类基因家族成员;在异源四倍体陆地棉TM-1和H7124中分别预测到了310和428个该酶类基因家族成员.通过分析陆地棉中预测到的310个该酶类基因家族成员在赤霉素敏感超矮突变体和野生型转录组中表达差异,发现16个基因具有显著性差异.利用这16个基因编码的蛋白质氨基酸序列与报道的拟南芥赤霉素氧化酶氨基酸序列进行进化分析,结果表明Gh D06G2009属于GA3ox氧化酶,Gh D01G0300和Gh D09G0746为GA2ox氧化酶,Gh A06G1341、Gh A07G1653、Gh A11G1416、Gh A13G0444、Gh A13G1787、Gh A13G2343、Gh D01G0055、Gh D07G0446、Gh D07G1858、Gh D08G2680、Gh D11G3415、Gh D13G0516、Gh D13G2157为GA20ox氧化酶.