α照射致BEAS-2B细胞损伤circRNA分子筛选及功能预测

• 作者: 党旭红 原雅艺 左雅慧 张睿凤 李幼忱 柴栋良 王仲文
• 来源期刊: 中国辐射卫生
• 学科: 生物学
• 关键词: α粒子 BEAS-2B 基因芯片 circRNA
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 放射生物学/论著
• 页码范围: 319-324,329
• 页数: 7页
• 分类号: Q691
• 语种: 中文
• DOI: 10.13491/j.issn.1004-714X.2020.04.001

摘要

目的 探讨α照射对BEAS-2B细胞circRNA表达的影响,筛选潜在标志分子.方法 利用α源照射装置对BEAS-2B细胞进行分次照射,每次照射剂量为0.1 Gy,每次照射后传代培养10代,累计照射4次,传代培养40代.选取累计照射2次并传代培养20代细胞2B-0.1Gy(2)-20和累计照射4次传代培养40代的细胞2B-0.1Gy(4)-40,利用基因芯片进行circRNA的检测,进而筛选标志分子;通过CircInteractome等在线工具进行circRNA分子的功能预测分析.结果 经α照射后,2B-0.1Gy(2)-20及2B-0.1Gy(4)-40分别获得差异表达circRNA 357个及451个;共同差异表达且趋势一致的circRNA 6个.circRNA功能预测显示,与6个circRNA相互作用miRNA达195个,且这些miRNA主要参与脂肪酸生物合成、赖氨酸降解、脂肪酸代谢等KEGG通路;5个circRNA相互作用蛋白及2个母源基因与肺癌患者总生存期显著相关.进一步利用Metascape构建了共同差异表达circRNA母源基因及蛋白的相互作用网络图.结论 α照射可诱导BEAS-2B细胞circRNA的差异表达,筛选获得6个潜在circRNA标志物分子;生物信息学分析揭示,候选circRNA可能通过“miRNA海绵”、“RBP海绵”等参与α照射致BEAS-2B细胞的损伤及恶性转化.