结直肠癌肝转移差异表达基因与信号通路分析

• 作者: 侯成志 朱世杰 李林潞 毛昀 苏毅馨 褚雪镭 陈峥
• 来源期刊: 中国肿瘤生物治疗杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结直肠癌 肝转移 生物信息学 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 787-793
• 页数: 7页
• 分类号: R735.3+4|R730.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3872/j.issn.1007-385x.2020.07.011

摘要

目的:探讨结直肠癌(colorectal cancer,CRC)肝转移的关键基因和分子机制,为CRC肝转移的治疗提供潜在靶点和生物标志物.方法:基于生物信息学方法从GEO数据库下载CRC肝转移基因表达数据集,筛选差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),利用DAVID在线工具对DEG进行GO和KEGG富集分析,构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络图,筛选出CRC关键基因并进行预后分析.结果:从183例CRC组织标本和39例CRC肝转移组织标本中筛选出321个DEG,其中上调基因153个、下调基因168个.GO和KEGG富集分析结果显示,DEG的功能主要涉及蛋白质激活级联反应、炎症反应、细胞外基质、血小板脱颗粒、补体与凝血级联反应等.PPI网络图筛选出8个CRC关键基因为ALB、APOB、FGA、F2、APOA1、SERPINC1、FGG和AHSG.生存分析发现,SERPINC1、FGG表达高的患者预后不良(均P<0.05).结论:DEG的生物学功能和信号通路与CRC肝转移的发生发展相关,8个CRC关键基因可能是CRC肝转移治疗的潜在靶点,SERPINC1、FGG可能成为新的预后标志物.