牦牛肌钙蛋白Ⅰ基因家族的克隆及组织表达分析

• 作者: 信金伟 向娅 姬秋梅 柴志欣 武志娟 王会 王吉坤 王嘉博 钟金城
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 肌钙蛋白Ⅰ基因家族 克隆 组织表达
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医
• 页码范围: 228-238
• 页数: 11页
• 分类号: S823.8+5
• 字数: 7268字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20190667

摘要

为了克隆TNNI基因家族,预测其蛋白结构和功能,并分析其在牦牛不同组织中的表达差异,以0.5岁健康的类乌齐牦牛为试验材料,采用RT-PCR技术克隆牦牛肌钙蛋白I基因家族的CDS区序列并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR技术检测TNNI基因家族各成员的mRNA表达水平.结果表明,TNNI1、TNNI2和TNNI3基因CDS区大小分别为564,549,639 bp,分别编码187,182,212个氨基酸残基.预测分析结果显示:TNNI基因家族编码的蛋白质均为偏碱性蛋白,蛋白结构不稳定,均无跨膜结构域,无信号肽,属非分泌型蛋白;二、三级结构均以α-螺旋为主,均含有肌蛋白超家族保守结构域.系统进化树分析表明:类乌齐牦牛TNNI1基因与水牛的亲缘关系最近,其次是绵羊、黄牛,与小鼠亲缘关系最远;TNNI2和TNNI3均与黄牛、水牛的亲缘关系较近,与其他亲缘关系较远.实时荧光定量PCR结果显示,TNNI1和TNNI2基因在臀肌中的相对表达量最高,且TNNI1基因在心脏、肝脏和肺脏中的表达量显著高于TNNI2基因(P<0.05),TNNI3基因在心脏中表达量较高,而在肺脏、臀肌和肝脏中表达量低.