甜果螨全线粒体基因组测序与分析

• 作者: 李朝品 赵亚男
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 真螨总目 无气门亚目 甜果螨 线粒体基因组 二级结构 系统发育
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 进化与系统学
• 页码范围: 354-364
• 页数: 11页
• 分类号: Q969
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2020.03.012

摘要

[目的]测定和分析甜果螨Carpoglyphus lactis线粒体基因组全序列,并在线粒体基因组水平探讨其在真螨总目(Acariformes)中的系统发育地位,为真螨总目分类及果螨科线粒体基因组研究提供科学依据.[方法]挑取实验室饲养的甜果螨成螨,用传统的酚氯仿抽提法和试剂盒提取法提取甜果螨基因组DNA.然后采用节肢动物或螨类线粒体基因的通用引物PCR扩增出甜果螨线粒体基因cox1,cob,rrnS和nad4-nad5的部分序列;再设计种特异性引物进行Long-PCR扩增和步移法测序,测出甜果螨线粒体基因组全序列.应用SeqMan,SEQUIN 9.0和tRNAscan等生物信息学软件,对甜果螨线粒体基因组的基因结构等进行生物信息学分析.最后基于17种真螨总目螨类的蛋白质编码基因,采用最大似然法构建系统发育树.[结果]甜果螨线粒体全基因组总长为14 060 bp(GenBank登录号:MN073839),为典型的闭合双链DNA分子,共由37个基因组成,包括13个蛋白质编码基因(PCGs)、22个tRNA基因和2个rRNA基因;甜果螨线粒体基因组还包括1个大的非编码区(large non-coding region,LNR).系统发育分析结果显示,甜果螨Carpoglyphus lactis属于无气门亚目粉螨总科(Acaroidae),与椭圆食粉螨Aleuroglyphus ovatus构成一支.粉螨总科(Acaroidae)和薄口螨总科(Histiostomatoidae)聚成一簇,与痒螨股(Psoroptidia)构成姐妹群.[结论]本研究首次获得并分析了甜果螨线粒体基因组全序列.甜果螨与椭圆食粉螨的亲缘关系较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李朝品	皖南医学院医学寄生虫教研室	235	781	13.0	17.0
2	赵亚男	皖南医学院医学寄生虫教研室	23	152	5.0	12.0