基于Cytb和D-Loop的日本囊对虾遗传多样性分析

• 作者: 侯春秀 杜景豪 王伟峰 王焕岭 陈秀荔
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 日本囊对虾 Cytb D-Loop 遗传结构 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 524-531
• 页数: 8页
• 分类号: S917
• 字数: 4681字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16378/j.cnki.1003-1111.2020.04.008

摘要

2018年8月至2019年3月,在浙江舟山、福建福州、福建厦门、广西北海和广东湛江5个近海水域,各采集约20尾日本囊对虾,取其腹部第六腹节肌肉,利用线粒体细胞色素b基因和DNA控制区分析方法,研究日本囊对虾这5个地理群体的种群遗传结构及变异情况,探明我国日本囊对虾种质资源现状.Cytb和D-Loop序列分析发现,5个群体中A+T含量分别为60.65％和82.54％,明显高于C+G含量(39.35％和17.46％).在Cytb和D-Loop序列中分别检测到了76和75个简约信息位点,55和78个单倍型.Cytb和D-Loop单倍型多态性分别为0.969和0.995,核苷酸多态性分别为0.033和0.036,群体内遗传距离分别为0.004～0.022和0.005～0.017,群体间遗传距离分别为0.007～0.068和0.012～0.075.分子方差分析显示,群体间变异是变异的主要来源,占总变异的70.01％和74.39％.单倍型系统发育树显示,北海和湛江群体聚为一支,其他3个群体聚为另外一支,同一单系间又有不同程度的分化.种群历史动态显示种群相对稳定,近期未曾经历过瓶颈效应和明显扩张.综上所述,5个日本囊对虾群体区域分化较为明显,具有较高的遗传多样性,呈现出较高的单倍型和核苷酸多态性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈秀荔	广西壮族自治区水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室	12	52	4.0	7.0
2	王焕岭	华中农业大学水产学院	5	10	2.0	3.0
3	王伟峰	华中农业大学水产学院	4	2	1.0	1.0
4	杜景豪	华中农业大学水产学院	1	0	0.0	0.0
5	侯春秀	华中农业大学水产学院	1	0	0.0	0.0