布鲁氏菌Omp25蛋白抗原表位的生物信息学分析

• 作者: 丁剑冰 张峰波 李智伟 沙桐 陈志强
• 来源期刊: 新疆医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 布鲁氏菌 Omp25 生物信息学 抗原表位
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 414-418
• 页数: 5页
• 分类号: R516.7
• 字数: 3388字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5551.2020.04.009

摘要

目的 利用生物信息学方法对羊布鲁氏茵Omp25蛋白进行分析,预测其T细胞以及B细胞的优势抗原表位.方法 从NCBI数据库中获取羊布鲁氏茵的Omp25蛋白的氨基酸序列.应用ProtParam在线软件分析Omp25蛋白的理化性质,应用SOMPA在线软件分析Omp25蛋白二级结构,应用Phyre2及SWISS-MODEL在线软件构建并分析Omp25蛋白三级结构,应用ABCpred和BepiPred等在线软件预测Omp25蛋白的B细胞抗原表位,应用SYFPEITHI和IEDB在线软件预测Omp25蛋白的T细胞抗原表位.结果 Omp25蛋白含有23个强碱性氨基酸,含有21个强酸性氨基酸,归类为亲水性稳定蛋白,Omp25蛋白的二级结构中α-螺旋占24.88％,β-折叠占25.35％,β-转角占2.82％,无规则卷曲占46.95％.联合不同软件的预测结果分析后,最终获得1段CD4+T细胞优势抗原表位、3段CD8+T细胞优势抗原表位以及3段B细胞优势抗原表位.结论 通过生物学信息的方法较为全面地预测了羊布鲁氏茵Omp25蛋白的优势T细胞以及B细胞抗原表位,为进一步研制羊布鲁氏茵表位疫苗构建提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁剑冰	新疆医科大学基础医学院免疫学教研室	140	750	15.0	21.0
2	李智伟	新疆维吾尔自治区人民医院临床检验中心	25	50	4.0	6.0
3	陈志强	新疆医科大学基础医学院免疫学教研室	15	9	2.0	2.0
4	张峰波	新疆医科大学第一附属医院检验科	45	129	7.0	9.0
5	沙桐	新疆医科大学基础医学院免疫学教研室	9	3	1.0	1.0