河北省鼠疫菌CRISPR基因分型及流行病学分析

• 作者: 刘合智 刘广 刘晓伟 史献明 周松 李伟 杜国义 王宇萌 王海峰 田亚汀 陈永明
• 来源期刊: 中华卫生杀虫药械
• 学科: 医学
• 关键词: 鼠疫菌 基因分型 规律聚集簇间隔短回文重复序列
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 生态研究
• 页码范围: 361-363
• 页数: 3页
• 分类号: R378.6+1
• 语种: 中文
• DOI: 10.19821/j.1671-2781.2020.04.019

摘要

目的 对河北省鼠疫菌株进行规律聚集间隔短回文重复序列CRISPR)基因分型.方法 利用聚合酶链式反应(PCR),采用3对CRISPR引物,对河北省分离的128株鼠疫菌进行扩增,测定扩增产物核酸序列并进行分析,确定河北省菌株CRISPR基因型.结果 128株鼠疫菌在3个CRISPR位点上有8种间隔序列,包括al、a2、a3、b1、b2、c1、c2、c3,分为2个基因型.118株鼠疫菌株为Cb2型,另外10株鼠疫菌均为新基因型(命名为Cc△1型).结论 通过CRISPR分析显示河北省鼠疫菌株遗传进化比较稳定,建立了CRISPR基因库,为鼠疫菌种群遗传进化和鼠疫防控的研究提供参考.