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基于基因组数据解析大球盖菇交配型系统
基于基因组数据解析大球盖菇交配型系统
作者:
侯娣
周陈力
唐利华
尚俊军
李燕
杨瑞恒
茅文俊
郭婷
陈群
鲍大鹏
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大球盖菇
A交配型位点
B交配型位点
共线性
摘要:
大球盖菇Stropharia rugosoannulata是一种具有较强木质纤维素降解能力以及高营养的重要食用菌.此菌属于四极性异宗结合担子菌,但是交配型位点结构仍未被解析.本研究利用基因组数据通过生物信息学方法进行大球盖菇的A和B交配型位点解析,并与其他大型真菌进行比较.结果 显示大球盖菇的A交配型位点包含了一对保守的HD1和HD2基因,位点上下游基因的共线性较高,与Galerina patagonica和砖红韧黑伞Hypholoma sublateritium相似度最高,A位点结构上也较为保守,在上下游具有保守的MIP、Sec61蛋白、甘氨酸脱氢酶和β侧翼蛋白.B位点包含5个信息素受体和3个信息素前体基因,与其他真菌相比较发现,B位点及上下游基因的共线性较差,表明在不同的真菌中B位点变异性较大.本研究所获得的结果将有助于诠释大球盖菇交配型位点结构,为今后的遗传育种提供了理论依据.
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基于基因组数据解析大球盖菇交配型系统
来源期刊
菌物学报
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关键词
大球盖菇
A交配型位点
B交配型位点
共线性
年,卷(期)
2020,(6)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1152-1161
页数
10页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13346/j.mycosystema.200088
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大球盖菇
A交配型位点
B交配型位点
共线性
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期刊影响力
菌物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国菌物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-6472
CN:
11-5180/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
2-499
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3221
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8
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