利用宏基因组测序技术对大熊猫阴道菌群的研究

• 作者: 何胜山 刘小强 吴代福 张兰 张志忠 张贵权 李凤 李才武 杨长江 瞿春茂 程建斌 董超 金森燕 魏荣平 黄炎
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 大熊猫 阴道菌群 宏基因组 衣原体
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 612-620
• 页数: 9页
• 分类号: Q93
• 字数: 4955字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2020.03.032

摘要

为了阐明大熊猫阴道微生物组成,为合理的进行大熊猫阴道感染治疗提供科学依据,本研究利用宏基因组测序技术对不同地区(组别:WLQ、BFX、DJY)和不同年龄(组别:A1、A2、A3)的14个大熊猫阴道分泌物样品进行微生物菌群分析.结果表明:在物种注释上,占主导地位的微生物为变形菌门、担子菌门、厚壁菌门和放线菌门;在功能注释上,注释为碳水化合物代谢、氨基酸代谢的基因是样品中含有微生物数量最多的功能基因;在抗性基因注释上,变形菌门比厚壁菌门和拟杆菌门更易携带耐药基因,且沙门氏菌耐药基因APH3-lb分布存在于所有样品中.此外,不同年龄组大熊猫阴道菌群差异显著;DJ Y组衣原体比例最高.耐药基因APH3-lb和衣原体对大熊猫繁育存在一定的威胁,需要持续关注.