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人TERT基因启动子区生物信息学分析
人TERT基因启动子区生物信息学分析
作者:
夏得淳
康晓静
李婷婷
赵娟
雷子贤
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
人TERT基因
启动子
CpG岛
转录因子
摘要:
目的:探讨人端粒酶逆转录酶基因启动子区的序列特征、转录因子及其结合位点.方法:从NCBI数据库中获取人TERT基因组序列及其启动子序列:利用EMBOSS 6.6.0、CpG finder 1.0和MethPrimer 1.0软件预测启动子区CpG岛的位置;利用Patch 1.0和PROMO 3.0.2软件预测可与TERT基因结合的潜在转录因子及结合位点.结果:TERT基因定位于5p15.33,基因序列全长共41881 bp,其启动子位于TERT基因5′端上游2500 bp处,全长2043 bp.TERT基因启动子区可能存在2个CpG岛和118个转录因子.结论:通过生物信息学软件对hTERT基因启动子进行预测分析,可提高对hTERT基因启动子的研究效率,以便更加深入了解hTERT基因的调控机制及其生物学功能.
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文献信息
篇名
人TERT基因启动子区生物信息学分析
来源期刊
肿瘤预防与治疗
学科
生物学
关键词
人TERT基因
启动子
CpG岛
转录因子
年,卷(期)
2020,(3)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
215-223
页数
9页
分类号
Q527|Q754
字数
4723字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-0904.2020.03.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
康晓静
新疆维吾尔自治区人民医院皮肤性病科
135
271
7.0
11.0
2
李婷婷
新疆维吾尔自治区人民医院皮肤性病科
17
27
2.0
4.0
3
赵娟
新疆维吾尔自治区人民医院皮肤性病科
14
15
2.0
3.0
7
夏得淳
石河子大学医学院
1
0
0.0
0.0
8
雷子贤
新疆维吾尔自治区人民医院皮肤性病科
1
0
0.0
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传播情况
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节点文献
引证文献
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节点文献
人TERT基因
启动子
CpG岛
转录因子
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
肿瘤预防与治疗
主办单位:
四川省肿瘤医院·研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-0904
CN:
51-1703/R
开本:
16开
出版地:
成都市武侯区人民南路四段55号
邮发代号:
62-142
创刊时间:
1973
语种:
chi
出版文献量(篇)
2761
总下载数(次)
11
总被引数(次)
7663
相关基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金
英文译名:
官方网址:
项目类型:
学科类型:
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