印度橄蝗线粒体基因组测定及系统发育分析

• 作者: 崔媛媛 茹凝玉 邱忠营 黄原
• 来源期刊: 广西林业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 线粒体基因组 印度橄蝗 瘤锥蝗科
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 471-479
• 页数: 9页
• 分类号: Q963
• 语种: 中文

摘要

从分子水平分析印度橄蝗(Tagasta indica)与近缘昆虫的系统发生关系,采用一代PCR测序方法对印度橄蝗的线粒体基因组进行测序,对序列进行拼接、注释和特征分析,并利用线粒体基因组的13个蛋白编码基因(PCGs)和2个核糖体RNA(rRNAs)构建贝叶斯(BI)树.结果表明,印度橄蝗的线粒体基因组长度为15531 bp,包括13个PCGs、22个转运RNA(tRNAs)、2个rRNAs和1个控制区;线粒体基因排列紧凑,基因排序与祖先序列相同.线粒体蛋白编码基因中,除nad2、cox1和nad6为非标准起始密码子GTG、ACT和TTG外,其余均为标准起始密码子ATN;终止密码子中,除cox3为不完全终止密码子TA外,其余均为完整终止密码子TAA或TAG.线粒体的22个tRNAs中,除trnSAGN缺少DHU臂外,其余均为典型三叶草结构.错配方式主要为G-U错配.构建的贝叶斯树支持瘤锥蝗科(Chrotogonidae)的单系性.