基于TP0136蛋白异质性建立一种新的苍白密螺旋体分子分型方法

• 作者: 刘雅慧 吕萍 张君 张晓辉 柯吴坚 王柳苑 谭玲俏 车雅敏 陈文韬 魏然 黄涛
• 来源期刊: 中华皮肤科杂志
• 关键词: 密螺旋体属 梅毒 基因分型技术 序列分析,蛋白质 TP0136
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 546-550
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.35541/cjd.20190351

摘要

目的 基于苍白密螺旋体属(TP)TP0136蛋白的异质性,建立一种新的TP分子分型方法.方法 从GenBank中查询9株梅毒苍白密螺旋体(TPA)、3株雅司苍白密螺旋体(TPE)、1株未分类的类人猿密螺旋体(FB)和1株地方密螺旋体(TEN)的TP0136开放阅读框(ORF)氨基酸序列并进行多重序列比对,得出TP0136蛋白分子分型结果.利用建立的TP0136蛋白分子分型方法,对2015年1月至2018年12月南方医科大学皮肤病医院收集的23株TPA临床分离株进行分类,并将分型结果与传统的Arp/Tpr/ TP0548三基因分型方法进行比较.结果 TP0136蛋白在不同种TP株中具有高度异质性,根据TP0136氨基酸序列,TPE、FB和TEN分为Ⅰ～Ⅳ4个亚型,TPA分为Ⅴ～Ⅹ6个亚型,TPA临床株分为Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ4个亚型.通过TPA传统的三基因分型方法可将23株TPA临床株分为13D/d、14D/f、14D/g、15D/f、16A/e 5型.将TP0136分型法与传统分型法相结合,可将上述临床株进一步细分为10型,其中14D/f型应用TP0136分型法可进一步分为3个亚型.结论 TP0136分子分型方法可用于TP种的区分,有助于传统TPA分子分型的进一步完善.