基于转录组分析的金针菇冷诱导原基形成的调控网络

• 作者: 伍土恒 余颖豪 叶志伟 林俊芳 郭丽琼 陈柏雄
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 金针菇 差异表达基因 原基 代谢途径
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1065-1076
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.200061

摘要

金针菇是低温结实型菌类,原基形成需要低温诱导,子实体发育也需要较低的温度,因此在工厂化生产过程中能源消耗大,生产成本高.本研究利用转录组测序对金针菇菌丝体和原基进行RNA-Seq分析,筛选得到7 935个差异表达基因,在原基形成后,有4 025个基因上调表达以及3 910个基因下调表达.通过GO注释和KEGG通路注释等生物信息学手段对代谢途径进行分析,可推测冷诱导形成原基的代谢调控为:当金针菇菌丝细胞接受到冷信号后,糖分转运相关的基因表达量下降,导致碳源摄取效率下降,因而糖酵解途径大部分相关基因表达量下调,进而导致三羧酸循环的底物乙酰辅酶A(乙酰CoA)合成量减少,整个细胞能量产出下降.此负反馈信号使细胞内储存的脂质进行氧化代谢的基因表达上调,产出乙酰CoA以供三羧酸循环产能.此负反馈导致不饱和脂肪酸的合成基因表达上调,以调节细胞流动性;同时磷脂和鞘脂代谢通路的相关基因表达大多上调,合成增多,细胞膜的组分因此改变,因此细胞进行重构进入另一种状态.与DNA复制、RNA转录和蛋白质合成的相关基因表达均大部分上调,表明了原基形成时细胞正处于增殖旺盛时期.本研究结果从分子水平上揭示了金针菇原基的形成伴随着能量来源的转变,各个代谢途径的相互调控以及相关基因的表达影响,为有目的培育高温型金针菇新品种,减少栽培能耗提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林俊芳	华南农业大学食品学院	95	904	18.0	26.0
2	郭丽琼	华南农业大学食品学院生物工程系	94	847	17.0	26.0
6	叶志伟	华南农业大学食品学院生物工程系	11	6	1.0	2.0
10	余颖豪	华南农业大学食品学院生物工程系	1	0	0.0	0.0
11	伍土恒	华南农业大学食品学院生物工程系	1	0	0.0	0.0
12	陈柏雄	华南农业大学食品学院生物工程系	1	0	0.0	0.0