基于线粒体COⅠ基因和D-Loop区序列的7个鲤群体遗传差异分析

• 作者: 刘康 叶香尘 杨著山 滕忠作 甘宝江 莫洁琳 邹辉 韦玲静 黄杰
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 金边鲤 COⅠ基因 D-Loop区 遗传多样性 遗传变异
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 1209-1216
• 页数: 8页
• 分类号: S965.116
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.05.028

摘要

[目的]从分子水平探究不同鲤群体的遗传进化差异,明确金边鲤线粒体基因的遗传进化多样性,为深入开展其遗传资源保护及综合利用提供理论依据.[方法]采用PCR直接测序分析金边鲤、晒江鲤、太湖鲤、福瑞鲤、建鲤、兴国红鲤和黑龙江野鲤等7个鲤群体的线粒体COⅠ基因和D-Loop区序列,通过MegAlign 7.0和DnaSP 5.0对多态位点数(S)、单倍型数(H)、核苷酸多样度(Pi)、单倍型多样度(Hd)、平均核苷酸差异(K)及群体内和群体间的遗传距离等遗传信息进行分析,运用Arlequin 3.5进行基因AMOVA分析,并以MEGA 7.0的邻接法(NJ)构建遗传进化树.[结果]获得7个鲤群体的COⅠ基因序列长787 bp和D-Loop区序列长878 bp.7个鲤群体间的COⅠ基因平均遗传距离为0.0035,其中金边鲤与晒江鲤的群体遗传距离最大(0.0011),与建鲤的群体遗传距离最小(0.0004);D-Loop区序列平均遗传距离为0.0292,其中金边鲤与黑龙江野鲤的群体遗传距离最大(0.0269),与福瑞鲤和建鲤的群体遗传距离最小,均为0.0102.在161份样品中,COⅠ基因共检测到12种单倍型,以单倍型HAP2最多;D-Loop区序列共检测到41种单倍型,其中HAP1、HAP2、HAP3、HAP4、HAP6、HAP7、HAP13和HAP15为金边鲤的特有单倍型.COⅠ基因的群体间变异贡献率为19.27％,群体内变异贡献率为80.73％;D-Loop区序列的群体间变异贡献率为20.29％,群体内变异贡献率为79.71％.从基于K2P遗传距离构建的遗传进化树可看出,建鲤、福瑞鲤和太湖鲤3个群体的亲缘关系最近,且同时与金边鲤聚为一小支.[结论]金边鲤的遗传多样性处于较高水平,可进一步选育获得金边鲤独有的优良性状品系,或通过基因辅助技术与其他鲤品种进行杂交而获得更优秀的新品系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄杰		17	26	3.0	4.0
2	滕忠作		16	10	2.0	2.0
3	叶香尘		20	14	2.0	2.0
4	韦玲静		13	5	1.0	2.0
5	刘康		4	4	1.0	2.0
6	邹辉		4	1	1.0	1.0
7	甘宝江		4	0	0.0	0.0
8	杨著山		1	0	0.0	0.0