SUB1在肝癌患者中的预后价值

• 作者: 刘冬 唐光华 唐德钧 张环 杨小兰 都敏 黄勇平
• 来源期刊: 岭南现代临床外科
• 学科: 医学
• 关键词: SUB1 肝癌 预后 TCGA Oncomine
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 论著与临床研究
• 页码范围: 425-430
• 页数: 6页
• 分类号: R735.7
• 字数: 3587字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-976X.2020.04.004

摘要

目的 利用TCGA及Oncomine数据库,分析SUB1在肝癌组织中的表达水平;评价SUB1在肝癌患者中的预后价值;利用基因集富集分析(GSEA)及及基因集变异分析(GSVA)分析受SUB1影响的细胞通路.方法 下载TCGA的肝癌队列RNA-seq数据,通过质量控制及标准化后分析其在肝癌组织及癌旁的表达变化,进一步在Oncomine数据库中进行分析验证;根据SUB1中位数表达量将TCGA数据库肝癌队列患者分为高表达及低表达两组,进行总生存(OS)分析及无复发生存(RFS)分析;GSEA及GSVA方法用于分析受SUB1调控的细胞通路.结果 SUB1在肝癌组织中的表达高于癌旁组织,P<0.0001;高表达SUB1的肝癌患者OS及RFS均低于低表达SUB1的肝癌患者;高表达SUB1可激活细胞周期、DNA复制等细胞通路.结论 SUB1在肝癌组织中高表达,SUB1可以作为肝癌患者总体生存和无病生存的预后因素.SUB1高表达激活了DNA复制及细胞周期等细胞通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨小兰	深圳市龙岗区人民医院普通外科	13	19	3.0	4.0
2	都敏	深圳市龙岗区人民医院普通外科	11	15	3.0	3.0
3	黄勇平	深圳市龙岗区人民医院普通外科	11	51	4.0	7.0
4	唐德钧	深圳市龙岗区人民医院普通外科	3	0	0.0	0.0
5	刘冬	深圳市龙岗区人民医院普通外科	1	0	0.0	0.0
6	张环	深圳市龙岗区人民医院普通外科	9	10	2.0	3.0
7	唐光华	深圳市龙岗区人民医院普通外科	6	2	1.0	1.0