数据挖掘技术分析神经纤毛蛋白1在脑胶质瘤中的表达及意义

• 作者: 叶益超 张哲 武卫周 钟士江 陈健
• 来源期刊: 解放军医药杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 神经纤毛蛋白1 神经胶质瘤 Oncomine数据库 数据挖掘 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 肿瘤基础与临床
• 页码范围: 58-63
• 页数: 6页
• 分类号: R730.264
• 字数: 3768字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-140X.2020.03.013

摘要

目的 研究神经纤毛蛋白1(NRP1)在脑胶质瘤中的表达及意义.方法 利用BioGPS数据库分析NRP1在正常组织中的表达;挖掘Oncomine数据库中关于NRP1的信息,并对资料进行二次分析,研究其在脑胶质瘤中的意义;利用癌症细胞系百科全书(CCLE)数据库查询NRP1在脑胶质瘤细胞系中的表达.结果 BioGPS数据库显示,NRP1在平滑肌组织、心脏、肝脏、甲状腺、视网膜、神经节及免疫细胞中表达量较高.Oncomine数据库中关于NRP1表达有统计学差异的研究结果有30个,NRP1表达增高的研究有15个,表达降低的研究有15个.其中4项涉及NRP1在胶质母细胞瘤与正常脑组织中表达的研究,共包含922个样本,meta分析表明,与正常脑组织相比,NRP1在胶质母细胞瘤中高表达(P=5.70×10-7).4级脑胶质瘤与正常脑组织、2级脑胶质瘤和3级脑胶质瘤比较NRP1均呈高表达(P<0.05),而正常脑组织、2级胶质瘤和3级胶质瘤组间NRP1表达量比较差异无统计学意义(P>0.05).CCLE数据库分析显示,在脑胶质瘤细胞系中NRP1 mRNA高表达.结论 通过对多个数据库的分析挖掘,发现NRP1在胶质瘤中高表达,且与胶质瘤的分级程度有关,这将为胶质瘤分子诊断的开发提供重要的理论依据,为深入研究NRP1在胶质瘤发生、发展中的作用奠定基础.