甜瓜侧枝长度QTL定位及候选基因预测

• 作者: 刘海英 孙守如 朱华玉 杨森要 杨路明 胡建斌 马长生 高路银
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甜瓜 侧枝长度 QTL定位 候选基因
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 605-615
• 页数: 11页
• 分类号: S652
• 字数: 7245字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2020.04.004

摘要

侧枝长度是植物的重要株型性状之一,是改良蔓生植物株型的有效切入点.本研究以甜瓜(Cucumis melo)短侧枝材料D581为父本、长侧枝材料H465为母本构建F2及F2:3群体,研究侧枝长度的变异规律,对其进行QTL定位并预测候选基因.研究结果表明,侧枝长度在F2和F2:3群体中呈典型的正态分布,6个侧枝性状指标的广义遗传率高于60％.利用253个SSR和InDel标记构建一张包含12个连锁群、覆盖基因组全长1433.3 cM的遗传图谱,标记间的平均遗传距离为5.67 cM.春秋两季共定位到31个QTL,单个QTL的表型贡献率为6.39％～16.46％,不同指标和不同环境下的7个QTL被共定位在LG8的SSR029716～ECM88区间,其累积贡献率达75.66％.通过对双亲进行深度重测序(>30×),并在共定位区段开发新的InDel标记,将这一区段缩小至185 kb,该区段注释有31个基因,其中3个基因参与了植物激素信号转导途径,是调控甜瓜侧枝发育最有可能的候选基因.本研究鉴定到的QTL和候选基因是当前甜瓜侧枝性状基因发掘研究的有益启示,也为甜瓜株型分子改良提供理论依据.