干旱胁迫和复水处理后梭梭转录因子的转录组分析

• 作者: 何江峰 刘红葵 房永雨 王力伟 王朝 王蕴华
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 梭梭 转录因子 转录组测序 干旱胁迫 差异表达
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 36-43
• 页数: 8页
• 分类号: S793.9
• 字数: 5319字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20190513

摘要

为了探明梭梭应对干旱胁迫和水分刺激的分子调控机理,利用高通量测序技术对正常浇水(对照,CK)、干旱胁迫组(轻度干旱胁迫组,LWS;中度干旱胁迫组,MWS;重度干旱胁迫组,SWS)和复水组(RSWS)梭梭的转录组和转录因子表达谱进行分析.结果表明:数据经de novo拼接共获得74641条非冗余Unigene,N50长度1537 bp,对转录组数据比对、注释后共检测到56个转录因子家族、1307个转录因子编码基因.与对照组相比,干旱胁迫组和复水组中的差异表达基因均以下调表达方式为主,其中,AP2-EREBP、MYB、bHLH、WRKY、NAC、ABI3VP1家族基因在各胁迫组中均表达且表达数较多.复水组中偏向通过增加AP2-EREBP、WRKY和NAC家族上调编码基因数量来实现梭梭幼苗对水分刺激的应答调节;而干旱组更偏向下调AP2-EREBP和bHLH的编码基因数量来实现幼苗对干旱胁迫的响应.干旱组和复水组测序结果的表达量(FPKM)与用荧光定量PCR法得到的基因表达量之间的相关性分别为0.9478(P<0.01),0.9672(P<0.01),结果证实了2种处理产生的差异表达基因数据的有效性.综合而言,AP2-EREBP、MYB和bHLH转录因子家族成员对梭梭干旱胁迫具有正负调控的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何江峰	内蒙古自治区农牧业科学院生物技术研究中心	4	6	1.0	2.0
2	王力伟	内蒙古自治区农牧业科学院生物技术研究中心	4	6	1.0	2.0
4	王蕴华	内蒙古自治区农牧业科学院生物技术研究中心	3	0	0.0	0.0
7	房永雨	内蒙古自治区农牧业科学院生物技术研究中心	4	6	1.0	2.0
8	王朝	内蒙古农业大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0