矩阵设计检测金针菇转化子外源DNA插入位点

• 作者: 刘媛媛 李依宁 杨环 王朦 谢宝贵 谢路昱 马新斌
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 二代测序 矩阵 农杆菌介导转化
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 983-992
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.200031

摘要

插入位点分析对于金针菇功能基因组学的研究极为重要,分析方法常用反向PCR、热不对称交错PCR、TaiI-PCR、染色体步移等,存在操作复杂、消耗时间长、特异性较差、效率低等缺点.近年来开始应用基因组重测序的方法,对转化子逐一测序与分析,工作量较大、费用较高.本研究应用矩阵设计,把多个转化子的DNA混合构成样品池,重测序后分析插入位点,M个样品池的测序数据可分析M×(M+1)/2个转化子的插入位点.应用矩阵设计构建6个样品池检测21个转化子,获得21个插入位点,表明这种方法可行、适合大样本分析,如突变体库.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢宝贵	福建农林大学菌物研究中心	186	1536	20.0	28.0
2	刘媛媛	福建农林大学菌物研究中心	8	17	3.0	4.0
3	李依宁	福建农林大学菌物研究中心	2	0	0.0	0.0
4	王朦	福建农林大学菌物研究中心	2	0	0.0	0.0
5	杨环	福建农林大学菌物研究中心	2	0	0.0	0.0
6	马新斌	福建农林大学菌物研究中心	2	0	0.0	0.0
7	谢路昱	新加坡国立大学计算机学院	3	8	2.0	2.0