杏衰退萎黄病病毒的siRNA高通量测序和RT-PCR鉴定

• 作者: 孙平平 张磊 李正男 陈雅寒 马强
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杏 衰退萎黄病 APV1 APV3 siRNA
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 725-733
• 页数: 9页
• 分类号: S662.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0433

摘要

为了明确引起杏衰退萎黄病的病毒种类,利用小干扰RNA (small interfering RNA,siRNA)高通量测序技术,结合生物信息寻找杏衰退萎黄样品中的病毒序列,发现存在亚洲李属病毒1 (Asian prunus virus 1,APV1)和亚洲李属病毒3(Asian prunus virus 3,APV3).为了验证该结果,采用RT-PCR对10个待测杏样品进行APV1、APV2和APV3检测,所有样品中未检测到APV2,检出APV1和APV3的样品数分别为3和4个.对检测到病毒的外壳蛋白(coat protein,CP)进行测序和系统进化分析,分别获得了3条653 bp的APV1和4条1 031 bp(或1 032 bp)的APV3 CP基因片段;3条APV1CP基因核苷酸序列一致性为99.2％～99.8％,与NCBI中已发表的26个APV1CP基因序列一致性为44.0％～99.8％;4条APV3CP基因序列一致性为78.5％ ～ 99.5％,与NCBI中已发表的26个APV3CP基因序列一致性为44.7％ ～ 99.5％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张磊	内蒙古农业大学园艺与植物保护学院	37	257	8.0	15.0
2	马强	内蒙古农业大学园艺与植物保护学院	36	111	6.0	10.0
3	陈雅寒	内蒙古农业大学园艺与植物保护学院	9	14	3.0	3.0
5	李正男	内蒙古农业大学园艺与植物保护学院	13	1	1.0	1.0
6	孙平平	内蒙古农业大学园艺与植物保护学院	13	1	1.0	1.0