萼脊兰SjHMGR基因克隆及表达分析

• 作者: 崔波 张燕 梁芳 牛苏燕 蒋素华 袁秀云 马杰
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 萼脊兰 SjHMGR基因 克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 521-528
• 页数: 8页
• 分类号: S682.31
• 字数: 5042字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.03.014

摘要

为探究兰科植物的花香基因,拓展兰科植物在花香分子育种方面思路.以萼脊兰花瓣为实验材料,按照NCBI上登录的兰科植物的HMGR基因序列设计引物,采用RT-PCR和RACE技术成功克隆萼脊兰3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因(SjHMGR).采用生物信息学方法,利用内参基因EF1a,对SjHMGR基因的时空表达特性进行分析研究.结果显示,获得的SjHMGR基因全长为1892 bp,开放阅读框为1689 bp,编码367个氨基酸,登录号为MK448292;SjHMGR有3个HMG-COA特殊位点,且属于HMG-COA超基因家族;SjHMGR编码的蛋白为亲水性蛋白;亚细胞定位于线粒体;蛋白质2级结构分析发现,SjHMGR蛋白具有α-螺旋、延伸链和不规则折叠.SjHMGR编码蛋白质的功能预测发现,SjHMGR在中间代谢起到非常重要的角色;同源性分析与系统进化树分析发现,萼脊兰SjHMGR蛋白与兰科的进化距离最近,在同1个分支上.qRT-PCR结果显示,SjHMGR基因在根和叶中的表达量很低,在萼片和花瓣中的表达较高,具有时空特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔波	郑州师范学院生物工程研究所	93	393	10.0	13.0
2	袁秀云	郑州师范学院生物工程研究所	86	590	12.0	20.0
3	马杰	郑州师范学院生物工程研究所	36	223	9.0	12.0
4	蒋素华	郑州师范学院生物工程研究所	51	180	7.0	10.0
5	张燕	郑州师范学院生物工程研究所	18	24	3.0	4.0
6	梁芳	郑州师范学院生物工程研究所	36	129	7.0	9.0
7	牛苏燕	郑州师范学院生物工程研究所	4	0	0.0	0.0