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摘要:
目的:阐述胸苷磷酸化酶(thymidine phosphorylase,TYMP)基因在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,CCRCC)中的表达及临床意义.方法:利用Oncomine及GEPIA数据库分析TYMP基因在正常肾组织及CCRCC组织中的表达差异;通过GEPIA数据库进行TYMP基因表达程度与病理分期的相关性分析;利用OncoLnc数据库对TYMP基因的表达水平与CCRCC患者生存率作Kaplan-Meier生存分析和log-rank检验;经MethHC数据库分析CCRCC组织和正常肾组织中TYMP启动子区DNA甲基化水平的差异;利用String-DB数据库分析与TYMP蛋白相互作用的蛋白;最后通过The Human Protein Atlas数据库分析TYMP蛋白在正常肾组织及CCRCC组织中的表达差异.结果:在mRNA及蛋白水平上,TYMP在CCRCC组织较正常肾组织中显著高表达,且TYMP mRNA表达水平越高,CCRCC病理分期越高;与TYMP基因低表达组相比,TYMP基因高表达的CCRCC患者总体生存率明显降低;CCRCC组织中TYMP启动子区DNA甲基化水平较正常组织甲基化水平显著降低;同时,与TYMP蛋白相关的蛋白有TK2,NT5M,CDA,UPRT,NT5C,UPP2,UMPS,TK1,UPP1和DPYD等,主要参与嘧啶核苷的合成、分解、代谢,转移戊糖基、蛋白质同源聚合等生物过程.结论:大样本数据挖掘能迅速获取CCRCC组织中TYMP基因表达的相关信息,为深入研究TYMP基因在CCRCC发生发展中的作用机制及预后奠定基础.
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文献信息
篇名 TYMP基因在肾透明细胞癌中的表达及临床意义
来源期刊 临床与病理杂志 学科
关键词 胸苷磷酸化酶 肾透明细胞癌 数据挖掘 甲基化
年,卷(期) 2020,(4) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 849-857
页数 9页 分类号
字数 4599字 语种 中文
DOI 10.3978/j.issn.2095-6959.2020.04.007
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陈洁 暨南大学附属第一医院泌尿外科 69 318 10.0 15.0
2 林晏廷 暨南大学附属第一医院泌尿外科 3 1 1.0 1.0
3 李灿楦 暨南大学附属第一医院泌尿外科 2 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
胸苷磷酸化酶
肾透明细胞癌
数据挖掘
甲基化
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
临床与病理杂志
月刊
1673-2588
43-1521/R
大16开
湖南省长沙市湘雅路110号中南大学湘雅医学院50号信箱
42-35
1981
chi
出版文献量(篇)
5329
总下载数(次)
9
总被引数(次)
24308
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导