基于转录组的三月李及其红肉突变体Expansin基因家族鉴定及分析

• 作者: 叶新福 周丹蓉 姜翠翠 方智振 林炎娟 潘少霖
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 李 转录组 expansin家族 生物信息学分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 919-928
• 页数: 10页
• 分类号: S662.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.09.001

摘要

[目的]Expansin是广泛存在于植物中的一类细胞壁蛋白,通过调节细胞壁柔韧性在植物生长发育过程中发挥作用.本研究旨在分析Expansin基因家族特征及其在果实成熟过程中的表达模式,并比较Expansin基因在三月李及其红肉突变体之间的差异表达.[方法]基于三月李及其红肉突变体果实成熟过程的转录组数据,采用生物信息学分析方法进行Expansin家族基因鉴定与分析.[结果]鉴定出33个李Expansin基因家族成员,编码蛋白长度在176～460 aa,分子量在19.21～51.33 kD,等电点4.62～9.83,大部分为位于细胞外的稳定亲水蛋白.系统进化树分析表明李Expansin家族成员可分为4个组:22个EXPA、6个EXPB、1个EXPLA和4个EXPLB.所有李Expansin蛋白质均具有保守的DPBB_1和Pollen_allerg_1结构域.保守基序分析表明,同一组Expansin成员具有相似的基序组成.9个Expansin基因在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中差异表达.[结论]Expansin在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中的表达模式存在显著差异.本研究结果可为解析李Expansin家族基因在果实成熟过程中的功能奠定基础.