葡萄HXK基因家族的鉴定与表达分析

• 作者: 刘涛 梁国平 毛娟 王萍萍 霍建强
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 HXK基因家族 生物信息学分析 荧光定量 糖代谢
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 57-64
• 页数: 8页
• 分类号: Q78|S663.03
• 字数: 5608字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20190242

摘要

为了对葡萄HXK基因家族进行鉴定和表达分析,利用拟南芥和玉米的HXK(Hexokinase)基因注册序列,从葡萄全基因组中鉴定得到HXK基因4个,并命名为VvHXK1、VvHXK2、VvHXK3和VvHXK4,对其进行生物信息学分析.蛋白质理化性质分析结果表明,每个基因编码的氨基酸个数分布在412-524 aa,VvHXK4是碱性蛋白,其余3个均为酸性蛋白;亚细胞定位分析表明,4个VvHXK基因都在细胞质中表达,且VvHXK4主要定位于叶绿体,而VvHXK2也存在于线粒体和细胞核中;蛋白质的二级结构预测表明,4个VvHXK基因编码的蛋白主要以α-螺旋为主;外显子结构分析表明,除VvHXK1含10个外显子外,其余3个都有9个外显子,说明VvHXK基因比较保守;启动子顺式作用元件分析表明,4个VvHXK基因均含有ABA响应元件和MYB及WRKY转录因子的结合区域,而VvHXK4中没有发现低温响应元件;系统进化树分析表明,VvHXK1与拟南芥AtHXK1的同源关系最近,推测其不仅具有调节生长发育,影响根系的生长等功能,而且具有加速衰老的作用.VvHXK2与马铃薯StHXK1的同源关系最近,推测其具有使叶绿体中的葡萄糖磷酸化活性升高的功能.VvHXK3与马铃薯StHXKRP1的同源关系最近,可能具有诱导离体叶片中糖表达的作用.VvHXK4与菠菜SoHXK1的同源关系最近.荧光定量分析表明,VvHXK2、VvHXK3和VvHXK4均在20 g/L的葡萄糖处理下相对表达量最高,即其对葡萄糖磷酸化最显著,在果糖和蔗糖的处理下表达量较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘涛	甘肃农业大学园艺学院	8	5	1.0	2.0
2	毛娟	甘肃农业大学园艺学院	91	429	10.0	18.0
3	霍建强	甘肃农业大学园艺学院	4	6	2.0	2.0
4	梁国平	甘肃农业大学园艺学院	13	7	2.0	2.0
5	王萍萍	甘肃农业大学园艺学院	3	1	1.0	1.0