石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析

• 作者: Krishna Poudel 唐丽颖 张富红 敬丹 曹尚银 李好先 赵弟广 陈丽娜 骆翔
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 石榴 SUT 基因家族 籽粒 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 485-494
• 页数: 10页
• 分类号: S66
• 字数: 5062字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20190351

摘要

[目的]对石榴SUT家族基因成员进行全基因组鉴定,并分析SUT家族基因成员的结构域特征、启动子序列、生化特征、进化关系和表达特性,为深入研究该基因作用及其分子调控机制提供参考.[方法]利用同源比对及HMMER模型鉴定石榴SUT基因家族成员;利用邻近法和基因结构分析解析石榴SUT基因及其启动子序列的系统发生关系.[结果]共鉴定了10个石榴SUT基因,可以分为3大类;石榴SUT基因及其启动子区的GC含量都明显低于其在拟南芥和水稻中的含量;石榴SUT家族基因GC含量远高于启动子区的GC含量;石榴SUT基因的序列长度与GC含量呈明显正相关;石榴SUT基因启动子区含有10种MYB元件;此外,4个石榴SUT基因(PgL0328370.1、PgL0099690.1、PgL0145810.1和PgL014770.1)在籽粒发育过程中发生了差异表达.[结论]SUT基因在进化过程中其序列和基因结构相对保守,而其启动子序列在进化过程中变化较大,SUT基因的表达量变化与籽粒发育显著相关.