大豆胞囊线虫病抗性相关bZIP转录因子的生物信息学分析

• 作者: 姜海鹏 田力峥 卜凡珊 赵雪 韩英鹏
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆胞囊线虫病 3号生理小种 转录组测序 bZIP转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学|Genetic & Breeding·Molecular Biology
• 页码范围: 703-711
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2020.05.0703

摘要

为分析大豆bZIP转录因子在大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫下的应答机制,促进大豆响应大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫机制的研究,本研究采用胞囊线虫病3号生理小种对抗线虫大豆品种东农L-10进行胁迫,对转录组测序数据中与抗性相关的bZIP转录因子进行在线生物信息学预测和分析.结果 共获得l8个与大豆胞囊线虫病3号生理小种相关的差异表达bZIP转录因子,不同bZIP转录因子之间的理化性质存在较大差异,大多数上调表达的bZIP转录因子为碱性等电点,而大多数下调表达的bZIP转录因子为酸性等电点;18个bZIP蛋白中含有多个丝氨酸(S)、苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)磷酸化位点,其中丝氨酸(S)位点最多;亚细胞定位显示2个bZIP转录因子定位于叶绿体,其余均定位于细胞核,与转录因子调控下游基因的表达特性相一致;18个bZIP蛋白的系统进化树分为2大类群,其中上调表达的bZIP转录因子和下调表达的bZIP转录因子亲缘关系较远;bZIP基因家族的成员都含有数量不等的motif结构,且不同bZIP基因之间保守结构域的氨基酸存在变异;蛋白二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主要构成元件;根据结构相似性,18个bZIP蛋白三级结构分为4类,不同bZIP转录因子三级结构的相似性暗示了功能上存在相似.