莲藕PPO基因密码子偏好性特征分析

• 作者: 惠小涵 柯卫东 程婷婷 郭宏波
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 莲藕 PPO 密码子 偏好性
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 438-446
• 页数: 9页
• 分类号: S645.1
• 字数: 4619字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2020.02.026

摘要

为了解莲藕多酚氧化酶(PPO)基因密码子使用偏好性、不同物种中PPO基因同源关系及异源表达受体,本研究运用CondonW和EMBOSS程序对莲藕PPO基因密码子进行分析.结果表明,莲藕PPO基因偏好性较弱但偏好于G/C结尾的密码子,其中高频密码子有24个(同义密码子相对使用度>1),偏好性最强的有3个(同义密码子相对使用度>2).用SPSS和MEGA软件对34种单子叶和双子叶植物的PPO密码子进行偏性比较和聚类分析,发现不同物种PPO基因存在不同密码子偏好模式,多数单子叶植物PPO基因密码子偏好性比双子叶植物强.PPO密码子相关性分析结果表明,莲藕PPO密码子使用偏好主要受突变压力的影响.在异源转化受体选择中,大肠杆菌真核表达系统适合莲藕PPO的异源表达,拟南芥则是莲藕PPO转基因的理想受体.莲藕PPO密码子偏好模式分析为后续的PPO基因遗传转化研究提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭宏波	西北农林科技大学化学与药学院	18	143	8.0	11.0
2	柯卫东	武汉市农业科学院蔬菜研究所	13	17	3.0	3.0
3	惠小涵	西北农林科技大学化学与药学院	2	0	0.0	0.0
4	程婷婷	西北农林科技大学化学与药学院	2	0	0.0	0.0