绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列测定和分析

• 作者: 于良斌 崔艳伟 庞红岩 康爱国 徐林波 王丹阳 王予彤 韩海斌
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 茧蜂科 优茧蜂亚科 绿眼赛茧蜂 线粒体基因组 系统发育
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 进化与系统学
• 页码范围: 1028-1038
• 页数: 11页
• 分类号: Q969.54
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2020.08.013

摘要

[目的]测定绿眼赛茧蜂Zele chlorophthalmus线粒体基因组全序列,分析其基因组结构及茧蜂科(Braconidae)部分类群的系统发育关系.[方法]利用Illumina MiSeq二代测序技术对绿眼赛茧蜂的线粒体基因组进行测序,对基因组序列进行拼装、注释,分析其结构特点和碱基组成;基于22种茧蜂科昆虫的COX1蛋白编码基因序列,应用最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建系统发育树,分析绿眼赛茧蜂与茧蜂科其他昆虫的系统发育关系.[结果]绿眼赛茧蜂线粒体基因组全长16 661 bp(GenBank登录号:MG822749),包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因,共37个基因,以及1个控制区.线粒体基因组有明显的核苷酸组成的偏倚,AT偏正,GC偏负,其A+T含量为82.83％.基因排列顺序与推测的昆虫祖先的序列不完全一致,tRNA基因7处发生重排.13个蛋白质编码基因均以ATN为起始密码子,以TAA为终止密码子.在22个tRNA基因二级结构中,除tRNAHis(H)缺失TΨC环和tRNACys(C)仅剩二氢尿嘧啶(DHU)臂和反密码子臂外,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构.基于COX1蛋白编码序列的系统发育分析结果显示,与绿眼赛茧蜂亲缘关系最近的是同属于赛茧蜂属的雪跗赛茧蜂Z.niveitarsis.[结论]本研究首次获得绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列.结果 表明绿眼赛茧蜂隶属于优茧蜂亚科(Euphorinae)赛茧蜂属,并支持赛茧蜂属的单系性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐林波	中国农业科学院草原研究所	64	381	11.0	14.0
2	韩海斌	中国农业科学院草原研究所	21	34	3.0	5.0
3	王丹阳	中国农业科学院草原研究所	3	0	0.0	0.0
4	崔艳伟	中国农业科学院草原研究所	6	10	2.0	3.0
5	王予彤	中国农业科学院草原研究所	2	0	0.0	0.0
6	于良斌	中国农业科学院草原研究所	3	1	1.0	1.0
7	康爱国	中国农业科学院草原研究所	2	0	0.0	0.0
8	庞红岩	中国农业科学院草原研究所	2	0	0.0	0.0