大豆响应涝害bZIP基因Glyma04g04170的生物信息学分析及互作蛋白预测

• 作者: 林延慧 唐力琼 徐靖 朱红林 王新华 王敏芬 徐冉 王效宁
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆 耐涝 转录组 bZIP转录因子
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学|Genetic & Breeding·Molecular Biology
• 页码范围: 727-733
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2020.05.0727

摘要

bZIP转录因子参与多种非生物胁迫,为研究涝害胁迫下大豆bZIP转录因子的调控作用,本研究对耐涝性极强大豆品种齐黄34进行淹水处理,对处理不同时间根部组织样品进行转录组测序,筛选出1个响应耐涝的差异表达的bZIP转录因子编码基因Glyma04 g04170,其qRT-PCR分析结果与转录组测序数据趋势一致,在4个取样时间点都下调表达,证明该转录组数据具有可靠性,Glyma04g04170可能通过负调控的方式参与大豆耐涝应答反应.Glyma04g04170蛋白保守结构域分析发现该蛋白内部含有bZIP保守结构域.蛋白三级结构中存在参与寡聚化作用的亮氨酸拉链保守结构域,同时也包含与特异DNA序列相结合、起核定位信号作用的N-x7-R/K结构.分离鉴定的Glyma04g04170蛋白是一个结合AREB/ABF的bZIP转录因子,预测结果显示,与该蛋白互作的蛋白主要是丝氨酸/苏氨酸残基蛋白磷酸酶.转录组和RT-qPCR数据表明,Glyma02g37090基因在4个取样时间点的表达量都呈显著性差异,处理与对照相比,表达量升高.