肺炎克雷伯菌中CRISPR调控耐药机制及其分布特征与分离地点的关系

• 作者: 崔聪聪 杨海燕 梁文娟 段广才 陈帅印 龙金照
• 来源期刊: 中华疾病控制杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肺炎克雷伯菌 CRISPR 分离地点 耐药性
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 939-945
• 页数: 7页
• 分类号: R378
• 语种: 中文
• DOI: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2020.08.015

摘要

目的 了解呼吸道标本肺炎克雷伯菌中成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)对耐药的调控机制,并分析其CRISPR分布特征与分离地点的关系.方法 收集并提取120株肺炎克雷伯菌的基因组DNA,通过扩增CRISPR/Cas(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated)系统相关基因CRISPR 1、CRISPR 2来确定CRISPR阳性菌株.CRISPR阳性菌株的耐药表型用BD Phoenix-100细菌鉴定仪进行检测,利用CRISPR Target寻找间隔序列同源噬菌体或质粒,并在Center for Genomic Epidemiology上查找同源质粒或噬菌体的耐药信息并检测间隔序列所在菌株的耐药基因,分析两者携带耐药基因的关系.采用CRISPR Finder分析CRISPR并运用多序列比对分析间隔序列的一致性.结果 CRISPR1、CRISPR2阳性率分别为12.50％和13.33％;间隔序列同源质粒与其所在菌株均携带共同的耐药基因,且菌株的耐药表型与其携带的耐药基因高度符合;相同地点菌株的CRISPR分布具有极高相似性.结论 肺炎克雷伯菌通过将外来质粒的耐药基因片段整合到菌株的基因组中实现对菌株耐药性的调控;CRISPR中间隔序列的分布与菌株分离地点密切相关,为临床治疗和感染控制工作提供理论依据.