向日葵锈病抗性相关microRNA的挖掘及其靶基因预测

• 作者: 宋阳 景岚 路妍 龚静
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 向日葵锈病 抗锈相关miRNA 靶基因预测 qRT-PCR
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 生物胁迫
• 页码范围: 687-700
• 页数: 14页
• 分类号: S432.2|S435.655
• 语种: 中文
• DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2020043

摘要

前期利用高通量测序技术及生物信息学分析方法,在向日葵上预测筛选到10个差异表达的新microRNA(miRNA)可能与锈病抗性相关.本试验利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,对筛选到的10个miRNA做进一步的定量验证.结果 表明,相比于水处理的健康叶片(对照组A),接种锈菌300生理小种的叶片中(抗病组B)Han-miR21、Han-miR25、Han-miR42表达量呈上调趋势,Han-miR11、Han-miR34、Han-miR43、Han-miR47、Han-miR67表达量呈下调趋势;接种锈菌737生理小种的叶片中(感病组C)Han-miR25、Han-miR42的表达量呈上调趋势,Han-miR11、Han-miR21、Han-miR34、Han-miR43、Han-miR47、Han-miR67表达量呈下调趋势.qRT-PCR的检测结果与前期高通量测序结果80％相一致.利用miRanda软件预测靶基因,10个miRNA共预测到117个靶基因,其中86个靶基因获得其生物信息学功能注释.运用miRBase数据库,对10个新预测miRNA进行同源性分析发现,新预测的10个miRNA与拟南芥、烟草、水稻等作物中参与病害逆境胁迫响应的miRNA有较高相似性(62％～100％).定量检测和验证miRNA作用的靶基因时发现,抗病组表达量上调的Han-miR21对应的靶基因有1个下调、表达量下调的Han-miR43对应的靶基因有3个上调,符合miRNA与其靶基因互作的规律.